Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCAPERQ9BY12 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms