Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms