Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms