Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms