Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM79Q9BSE2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM79Q9BSE2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM79Q9BSE2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM79Q9BSE2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM79Q9BSE2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms