Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms