Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOXF2Q9BQY4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms