Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms