Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORT1Q99523 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms