Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRBNQ96SW2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms