Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRRC1Q96M27 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms