Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms