Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC9

VMP1, Vacuole membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1Q96GC9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VMP1Q96GC9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms