Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY7

MTBP, Mdm2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTBPQ96DY7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MTBPQ96DY7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms