Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAF2Q96CS3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms