Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ULK4Q96C45 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ULK4Q96C45 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms