Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCA10Q8WWZ4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms