Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SELENOMQ8WWX9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms