Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FUNDC1Q8IVP5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms