Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SKAP1Q86WV1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms