Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms