Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRINP3Q76B58 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms