Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM72Q6ZMU5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM72Q6ZMU5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms