Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCBE1Q6UXH8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms