Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms