Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms