Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LDLRAP1Q5SW96 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms