Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCID2Q5JVF3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms