Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D3Q587I9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms