Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB6CQ53S08 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms