Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP41Q3LFD5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP41Q3LFD5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms