Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms