Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCBQ16585 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCBQ16585 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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