Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLFQ16534 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLFQ16534 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLFQ16534 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLFQ16534 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLFQ16534 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLFQ16534 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLFQ16534 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLFQ16534 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLFQ16534 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLFQ16534 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLFQ16534 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLFQ16534 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLFQ16534 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLFQ16534 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms