Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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