Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms