Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VPS72Q15906 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms