Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF4Q15306 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms