Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDGFRLQ15198 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDGFRLQ15198 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms