Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COL19A1Q14993 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COL19A1Q14993 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms