Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CHD4Q14839 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHD4Q14839 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHD4Q14839 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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