Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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