Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNC3Q14003 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNC3Q14003 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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