Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms