Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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SHROOM2Q13796 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHROOM2Q13796 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
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