Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSTA3Q13630 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms