Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms