Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNMA1Q12791 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms