Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IFFO1Q0D2I5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IFFO1Q0D2I5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms