Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLFN5Q08AF3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms